यस कार्यालयका प्रमुख कार्यहरु निम्न लिखित छन्:

१.  आयुर्वेद तथा  वैकल्पिक चिकित्सा पद्धतिहरु मार्फत उपचारात्मक तथा पुनर्स्थापना  स्वास्थ्य सेवा प्रवाह गर्ने ।

२.  स्वस्थ ब्यक्तिको स्वास्थ्य प्रवर्धन तथा रोग प्रतिकारका लागि स्वास्थ्य अभियान , प्रचारात्मक कार्यक्रम , तालिम, गोष्ठी आदि जनस्वास्थ्यसंग सम्बन्धित गतिविधि संचालन गर्ने ।

३. जिल्ला भित्र संचालनरत आयुर्वेद तथा वैकल्पिक चिकित्साका निजी स्वास्थ्य संस्था तथा तिनका गतिविधिहरु नियमन गर्ने ।

४. कार्यालयको कर्मचारी व्यवस्थापन तथा प्रशासनिक कार्य गर्ने ।

५. आर्थिक प्रशासन तथा अन्य तालुक निकायबाट निर्देशिक कार्यसम्पादन गर्ने  ।